Anno Accademico 2022/2023
Docente Ivan Rivalta
Crediti formativi 1
SSD CHIM/02
Lingua di insegnamento Italiano
Modalità di erogazione In presenza (Convenzionale)
Al termine del seminario lo studente avrà compreso i principi fondamentali alla base della comunicazione (allosterica) che avviene attraverso fenomeni chimico-fisici all'interno dei sistemi proteici. Tale comprensione implica l'acquisizione di conoscenze di base sulla struttura e la dinamica delle proteine, sul concetto di comunicazione allosterica, sui metodi computazionali utilizzati per comprendere i sistemi proteici e sulla teoria dei grafi funzionale all'analisi di tali sistemi complessi.
Il seminario avrà come oggetto le seguenti tematiche:
La descrizione delle tecniche principali per l'analisi delle reti di comunicazione chimica in proteine avverrà tramite illustrazione delle applicazioni su sistemi modello (enzimi allosterici) e proteine di grande rilevanza biologica (complessi proteine/DNA e/o RNA tipo CRISPR-Cas9 e Spliceosoma).
Le diapositive e il materiale presentato a lezione saranno disponibili agli studenti e alle studentesse.
Sono poi suggeriti i seguenti testi di supporto e approfondimento:
David Whitford - Proteins: Structure and Function (2005, John Wiley & Sons) (136553319)
Daan Frenkel, Berend Smit - Understanding molecular simulation: from algorithms to applications (2002, Academic Press)
Di Paola, L.; Giuliani, A. Allostery: Methods and Protocols. Springer: 2021; Vol. 2253.
Lezioni frontali utilizzando lavagna elettronica con videoproiettore e slides.
La prova di idoneità consiste in un incontro (eventualmente collettivo) successivo alla fine del seminario in cui ogni studente dovrà discutere un approfondimento critico nella forma di una tesina o una presentazione power point che potrà essere individuale o di gruppo purché sia chiaramente identificabile il contributo del singolo, da concordare con il docente. In caso siano previste attività di laboratorio, potrà essere presentato in alternativa un elaborato o manufatto che attesti le attività svolte.
Lavagna elettronica con videoproiettore e proiezione di slides.
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