Il laboratorio ospita un microscopio a fluorescenza rovesciato IX83 Olympus, posizionato su un banco anti-vibrazione. Lo strumento è equipaggiato con un sistema di illuminazione a LED per fluorescenza e un revolver portaobiettivi a 6 posizioni. La configurazione include obiettivi planari apocromatici 10x, 20x, 40x e 60x, ottimizzati per imaging in fluorescenza.
Il sistema è dotato di una torretta porta filtri motorizzata a 6 posizioni e un sistema di messa a fuoco motorizzato con risoluzione Z di 0.01 µm. Il microscopio è collegato a una workstation dedicata per l'acquisizione e l'analisi delle immagini attraverso il software cellSens.
L'ambiente è mantenuto a temperatura controllata (21±1°C) per garantire la stabilità delle misurazioni, con un sistema di illuminazione regolabile per ottimizzare l'acquisizione dei segnali fluorescenti.