Junior assistant professor (fixed-term)
ORCID ID 0000-0003-3494-298X
Scopus ID 55946444200
Web of Science ID N-8744-2015
Research activities
His research field is characterized by a multidisciplinary approach, at the cutting edge between nanochemistry and biotechnology. His main research topics are i) the dispersion of carbon nanomaterials (fullerenes, nanotubes, graphene, and nanodiamonds) in aqueous media using proteins as supramolecular hosts, and ii) covalent and non-covalent bioconjugation of proteins and phages with photosensitizing/imaging/anticancer agents, aiming to develop innovative phototheranostic platforms for cancer treatment
Research experience
Visiting fellow at Center for BioNano Interactions - University College of Dublin, Ireland. "Protein corona composition of fluorescent nanodiamond for imaging applications". Host prof. Kenneth Dawson
Visiting fellow at Technion - Israel Institute of Technology, Haifa, Israel. "Characterization of bioinspired nanocomposites based on carbon nanomaterials". Italy - Israel collaboration project CaFuMa. Host prof. Boaz Pokroy
Education
PhD in Chemistry at Università di Bologna - “Carbon based nanoparticle hybrids for advanced functional materials". Supervisor prof. Marco Montalti
Master degree in Photochemistry and Molecular Materials at Università di Bologna (110/110 cum Laude). Thesis in Inorganic Chemistry "Synthesis and characterization of nanocomposite materials based on calcium carbonate and graphene oxide". Supervisor prof. Giuseppe Falini
Bachelor degree in Chemistry at Università di Bologna (110/110 cum Laude) - Thesis in Computational chemistry “Theoretical study of molecular motors", MM simulations of Feringa molecular motors. Supervisor prof. Francesco Zerbetto
Reviewing activity
Royal Society of Chemistry, American Chemical Society, MDPI, Elsevier journals. Publons profile
Third mission activity
Participation at Pint of Science Bologna 2018 as a speaker
Team member of Pint of Science Bologna
Organizer of Pint of Chemistry Italy 2019 celebrating the 150th anniversary of the periodic table
Invited speaker at middle/high schools and participation in scientific dissemination programs.
Postdoctoral Research Fellow
Research activity
Her research activity focuses in understanding how reaction mechanisms are affected by catalysts employing the methods of quantum mechanics and hybrid quantum mechanics/molecular mechanics. In particular, the catalytic role of enzymes, metallo-complexes, carbon nanostructures and organic molecules in organic synthesis is investigated.
Furthermore, she studies hybrid assemblies (complexes made of proteins or biosystems with non standard ligands, carbon nanostructures or carboranes) in order to quantify the driving forces that govern the binding mechanism in the adduct formation. She is a computational chemist with a strong organic and good physical-chemistry preparation. Competence in the use of ad hoc softwares as Gaussian, AMBER and AmberTools. Basic knowledge of Bash and Python programming languages.
Education
PhD in Chemistry (Organic Computational Chemistry) at University of Bologna. “Computational investigations into reaction and binding mechanisms” (in course). Supervisor Prof. Andrea Bottoni.
Master of Science (M.Sc.) at University of Bologna, in “Methodologies of synthesis and bio-organic chemistry” (110/110). Thesis in Organic Computational Chemistry “Human Tyrosylprotein Sulfotransferase 2: a computational study of binding and catalytic mechanism”. Supervisor Prof. Andrea Bottoni.
Awarded as best thesis for “Theoretical simulations of enzymatic mechanisms”.
Bachelor’s degree at University of Bologna, in “Chemistry” (101/110). Thesis in Synthetic Organic Chemistry “Synthesis of Endomorphin-1 analogues containing b-deidro-proline”. Supervisor Prof. Alessandra Tolomelli.
Postdoctoral Research Fellow
Research activity
His studies concern the computational investigation of reaction mechanisms employing both QM, MM and hybrid QM/MM methods. In particular, those reactive processes catalyzed by: Biosystems (enzymes and deoxyribozymes) and alternative catalysts (external electric fields, carbon nanotubes and other enginerized synthetic molecules). These studies may help the development of alternative synthetic applications.
He is also studying the electronic properties of carbon nanoparticles in solution and inside protein pockets, adopting different computational approaches (MD simulations, DFT, TDDFT). The aim is to model and investigate their behaviour for experimental applications in photodynamic therapy.
He is a computational organic chemist, his expertise are mainly based on calculation software (Gaussian and Amber software) and he has basic knowledge of C++ programming language and UNIX.
Education
Master degree in Chemistry at Università di Bologna (110/110 cum Laude). Thesis in Computational Chemistry “ Computational study of the reaction mechanism of deoxyribozyme 9DB1”. Supervisor dr. Matteo Calvaresi
Bachelor degree in Chemistry at Università di Bologna (110/110 cum Laude). Thesis in Organic Chemistry “ Synthesis of bioactive isoquinoline alkaloids”. Supervisor prof. Pier Giorgio Cozzi
Postdoctoral Research Fellow
Research activity
Her research activity is focused on the identification of natural and synthetic compounds with potential chemopreventive and chemotherapeutic activity against cancer and the characterization of their mechanism of action at cellular and molecular levels. She is currently enrolled in the "LIGHTNING" project, which aims to exploit the intrinsic photosensitizer properties of some anticancer agents or cytotoxic natural compounds and to examine the potential enhancement of their cytotoxicity by photoactivation with light irradiation.
Education
PhD in Pharmacology at Università di Bologna – “In vitro study of natural compounds and their semi-synthetic derivatives as inducers of non-canonical cell death”. Supervisor prof. Carmela Fimognari.
Degree in Pharmacy at Università di Bologna (110/110 cum Laude) - Thesis in Toxicology “In vitro study of the anticancer activity of two hydro-alcoholic extract fractions of H. indicus”. Supervisor prof. Carmela Fimognari.
BACHELOR STUDENTS
Francesco Loforese "Sviluppo di nanoparticelle di proteine come piattaforme fototeranostiche"
Alice Linari "Sintesi di nanoparticelle a base tiofenica per applicazione in terapia fotodinamica antimicrobica"
Tommaso Salvador "Sintesi e funzionalizzazione di nanoparticelle di BSA per terapia fotodinamica"
Sara Cascone "Studio e Ottimizzazione di Strategie Sintetiche per la Produzione di Sistemi Supramolecolari Basati sull’Interazione tra Carborani e Biomolecole"
Riccardo Tassoni "Addotti albumina-nanotubi di carbonio per applicazioni in terapia fototermica"
Davide Lardani "Studio computazionale della reazione di Diels-Alder in nanotubi di carbonio"
Giulia Giugliano "Identificazione di targets proteici per cucurbiturili tramite tecniche di reverse docking"
Riccardo Ghetti "Studio dell'interazione tra amminoacidi e closo-carborani mediante simulazioni di dinamica molecolare"
Daniele Maccarone "Studio ed applicazione di protocolli di reverse docking in processi di virutal screening"
Alessandro Calza "Studio dell'interazione tra amminoacidi e Fullerene C60 mediante simulazioni di dinamica molecolare"
Luigi Gamberini "Sintesi, caratterizzazione e applicazioni di proteine cationizzate"
Ilario Baù "Cationizzazione di BSA come strategia per targeting in Terapia Fotodinamica antibatterica"
Luca Bartolucci "Sintesi e caratterizzazione di nanoparticelle di proteina cationizzate"
Pietro Pecchini "Sintesi di nanoparticelle di proteine per applicazioni in ambito biomedico"
Marinella Difonzo "Sintesi di nanoparticelle di proteine per applicazioni in ambito biomedico"
Marta Proietto "Determinazione dell'attività fotodinamica di addotti C60@proteina"
Riccardo Pinotti "Analisi delle interazioni fra Lisozima e CNTs, un approccio computazionale"
Francesca Tacchi "Computational analysis of carborane-based VDR ligand"
Maria Elena Castellani "Costruzione di un database di strutture cristallografiche di HSA per applicazioni di ensemble docking"
Irene Dalmonte "Effetti degli inquinanti marini sulla crescita di organismi calcificanti: studio in vitro dell'interazione tra farmaci e cristalli sintetici di CaCO3"
Yuri Samplalmieri "Nanopinze peptidiche per la dispersione di Fullerene C60 in acqua"
Genny Cau "Nuove piattaforme per "water remediation": chitina da loligo vulgaris"
Lucrezia Barchi "Nuove piattaforme per water remediation: filamenti di bisso"
Francesco Trozzi "Ottimizzazione del sito di legame del lisozima con C60 mediante "in silico" mutagenesi"
Maria Vittoria In Campo "Sintesi e caratterizzazione di cristalli di calcite per il rilascio controllato di farmaci"
Marta Tavoni "Sistemi di rilascio controllato di chelati di ferro per applicazioni nanotecnologiche in agricoltura"
Dario Stefani "Sistemi di rilascio controllato di farmaci basati sulla penna di Loligo Vulgaris"
Michele Tomasini "Studio meccanicistico di reazioni competitive E2 vs SN2 all’interno di nanotubi di carbonio"
Giulia Magnabosco "Cristalli di carbonato di calcio/doxorubicina: un nuovo metodo per il rilascio controllato di farmaci antitumorali"
Paolo Paci "Sintesi e caratterizzazione di compositi a base di fibrina e grafene ossido"
MASTER STUDENTS
Antonio Paparesta "General method for diamination of alkenes"
Michael Augello "Determinazione della fotoattività di chemioterapici approvati, per applicazioni in terapia fotodinamica"
Nicolò Mercorelli "Batteriofago M13: una versatile piattaforma teranostica per terapia fotodinamica"
Camilla Di Girolamo "Synthesis of multifunctional nanomaterials based on bovine serum albumin bioconjugates for phototheranostic and biosensing applications"
Kelment Zahoaliaj "Post-funzionalizzazione di nanoparticelle a base tiofenica per terapie PDT/PTT combinate"
Daniele Gigante "Bioconiugazione di batteriofagi M13 per applicazioni in nanomedicina"
Aurelio Spinoso "Sintesi, caratterizzazione e bioconiugazione di nanoparticelle di albumina per applicazioni fototeranostiche"
Giulia Giugliano "Synthesis and characterization of fullerene@protein adducts: a computational and experimental study"
Soraia Flammini "Sintesi e caratterizzazione di nanoparticelle di politiofene per applicazioni in nanomedicina"
Giuseppina Rabitti "Orthogonal modification of M13 bacteriophages for nanomedicine applications"
Maria Montrone "Sintesi di derivati a base oligotiofenica per applicazioni per in ambito fototeranostico"
Alessia Marconi "Sintesi e caratterizzazione di addotti proteina-fotosensibilizzatore per applicazioni fotodinamiche: uno studio computazionale e sperimentale"
Manuele Di Sante "Derivatizzazione di fullereni per applicazioni in terapia fototermica e fotodinamica"
Giulia Mirra "Sintesi e caratterizzazione di bio-coniugati di carbonio e albumina per applicazioni in terapia fotodinamica e fototermica"
Davide Paci "Sintesi e caratterizzazione di addotti C60@Mioglobina e i suoi derivati per la terapia fotodinamica"
Roberta Pascazio "Photodynamic therapy carriers: a computational study - Fullerene complexes with amino acids"
Leonardo Bernal "Computational study of the interactions between Chlorin-e6 and proteins"
Riccardo Aguti "Studio computazionale di Metallocarborani per applicazioni in nanomedicina e nanotecnologie"
Beatrice Cipriani "Designing M13 Phage-Gold Nanoclusters Hybrids as Innovative Platform for Nanomedicine "
Roberto Saporetti "Bioconjugation of M13 phages with photosensitizers for Photodynamic Therapy targeted against bacteria and tumor cells"
Riccardo Pinotti "Synthesis of C60@protein adducts for Photodynamic and Sonodynamic Therapy"
Silvia Fanti "Ottimizzazione di nanosistemi ibridi fullereni-proteine"
Dalila Magnifico "Sintesi di nanopinze peptidiche per la dispersione di fullerene in ambiente fisiologico"
Giulia Strever "Ingegnerizzazione della mioglobina per applicazioni in terapia fotodinamica"
Edoardo Toscanella "Sintesi e caratterizzazione di fluorofori oligotiofenici per applicazione fotodinamica e fototermica"
Marta Tavoni "Utilizzo di apo-emoproteine come carrier per applicazioni in terapia fotodinamica"
Sonny Forni "Utilizzo di albumina di siero umano come trasportatore di agenti per la terapia fotodinamica"
Paolo Paci "Sintesi e caratterizzazione di compositi idrogel/grafene"
Fabio Bologna "Computational study of the interactions between gadofullerenes and proteins"
Edoardo Jun Mattioli "Computational Study of the Reaction Mechanism of Deoxyribozyme 9DB1"
Giulia Magnabosco "In vivo study of interaction between carbon nanoparticles and photosynthetic systems"
Federica Nicolini "Phenylalanine based peptides as molecular tweezers to disperse fullerene C60 in water"
Andrea D'Armento "Synthesis and characterization of peptide tweezers conjugable through click chemistry to disperse C60 in water"
Giuseppe Guarracino "Sintesi e caratterizzazione di addotti fra proteine e fullerene C60"
Stefano Conte "Preparazione e caratterizzazione del sistema ibrido fullerene/lisozima: un modello per la nanobiotecnologia"
